新型コロナウイルス [ヨコハマ]
新型コロナウイルス
心配です。
いろいろな人が集まるイベントは、中止になっているのに、通勤電車は、相変わらず満員だし。
どこに行っても、マスク売っていないし...
今回の新型ウイルスの流行では、中国は、ネット上に積極的に情報を公開しているようです。
中国疾病预防控制中心 (中国疾病予防管理センター)
新型冠状病毒肺炎疫情分布 http://2019ncov.chinacdc.cn/2019-nCoV/global.html
National Genomics Data Center には、各国の感染者のウイルスの遺伝子配列のデータも公開されています。
2019 Novel Coronavirus Resource
https://bigd.big.ac.cn/ncov/?lang=en
R言語のggmsa (Plot Multiple Sequence Alignment using 'ggplot2' : https://cran.r-project.org/web/packages/ggmsa/index.html )というライブラリを使って、2019 Novel Coronavirus Resourceにあるデータから新型コロナウイルスの系統樹を作ってみました。
新型コロナウイルスには、遺伝子の違うグループがいくつかあって、だいたい地域ごとにグループがわかれていることがわかります。
(左下に日本で発見されたウイルスのグループがあります。)
心配です。
いろいろな人が集まるイベントは、中止になっているのに、通勤電車は、相変わらず満員だし。
どこに行っても、マスク売っていないし...
今回の新型ウイルスの流行では、中国は、ネット上に積極的に情報を公開しているようです。
中国疾病预防控制中心 (中国疾病予防管理センター)
新型冠状病毒肺炎疫情分布 http://2019ncov.chinacdc.cn/2019-nCoV/global.html
National Genomics Data Center には、各国の感染者のウイルスの遺伝子配列のデータも公開されています。
2019 Novel Coronavirus Resource
https://bigd.big.ac.cn/ncov/?lang=en
R言語のggmsa (Plot Multiple Sequence Alignment using 'ggplot2' : https://cran.r-project.org/web/packages/ggmsa/index.html )というライブラリを使って、2019 Novel Coronavirus Resourceにあるデータから新型コロナウイルスの系統樹を作ってみました。
library(Biostrings) library(ape) library(ggtree) library(ggmsa) sequences = "2019nCoV_20200219.fasta" x = readAAStringSet(sequences) d =as.dist(stringDist(x, method = "hamming")/width(x)[1]) tree = bionj(d) p =ggtree(tree, lwd=0.1, layout="daylight",branch.length='none' ) + geom_tiplab(align = FALSE, geom = "text", size=3) p
新型コロナウイルスには、遺伝子の違うグループがいくつかあって、だいたい地域ごとにグループがわかれていることがわかります。
(左下に日本で発見されたウイルスのグループがあります。)
脱兎 [ヨコハマ]
みごとに、逃げられてしまいましたね...
トルコのサバハ紙によると、こんな感じだったらしいのですが、本当はどうだったんでしょう...
https://www.sabah.com.tr/yasam/2020/01/03/carlos-ghosn-olayina-iliskin-mng-jetten-flas-aciklama
たま自動車 [ヨコハマ]
今週の、日産グローバル本社ギャラリー
「日産の電気自動車(EV)の歴史を楽しもう!」ということで、たま自動車が並んでいました。
手前のクリーム色の車が、電気自動車の「たま」で、奥の水色の車は、ガソリン車の「たまトラック」です。
「たま」は、東京電気自動車(後に、たま電気自動車、たま自動車、プリンス自動車工業となっていく杉並区桃井三丁目にあった会社)が開発した電気自動車です。
たまが発売された1947年当時は、敗戦直後で、国内では石油不足でしたが、一方で家庭電化製品はまだほとんどなく、多くの工場が破壊されて大口の電力需要者もなく、電力の供給が余剰気味だったため政府は電気自動車の生産を推奨していたそうです。