実効再生産数の推定をやってみました

今日も、まぶしい青空が広がりました。


最近、テレビでよく見る、クラスター対策班・西浦博北海道大学教授のCOVID-19の実効再生産数モデルとデータが、jupyterで公開されていました。
https://nbviewer.jupyter.org/github/contactmodel/COVID19-Japan-Reff/tree/master/

＜追記＞
GitHubに公開されているものの方が、良いみたいです
https://github.com/contactmodel/COVID19-Japan-Reff
---

オープンソースのRとStan (rstan)を使っているので、パソコンがあれば、誰でも（？）ためすことができます。

（グラフの表示がなかったので、追加しました。）





イギリスのインペリアルカレッジの、COVID-19の死亡数の推定モデルもRとStanを使っていて、プログラムとデータがGitHubで公開されています。
covid19model
https://github.com/ImperialCollegeLondon/covid19model

家のノートパソコンだと計算するのに１０分以上かかる...


有料のソフトではなく、オープンソースを利用して、データやプログラムを公開することで、多くの人にレビューしてもらうことや、知識を共有することができることは、とても良いことだと思います。